研究業績 (2006, 2007)

[原著] [総説等] [学会発表] (written in Japanese and English)

原著

  1. Ishikawa, S., Hirota, S., Neya, S., Funasaki, N.: Molecular Motions of α-Cyclodextrin on a Dodecyl Chain Studied by Molecular Dynamics Simulations. Chem. Pharm. Bull., 54, 528-534 (2006)
  2. Yokoyama, T., Neya, S., Antonio, T., Yonetani, T., Park, S.-Y., Tame, J. R. H.: R-State Hemoglobin with Low Oxygen Affinity: Crystal Structures of Deoxy Human and Carbonmonoxy Horse Hemoglobin Bound to the Effector Molecule L35. J. Mol. Biol., 356, 790-801 (2006)
  3. Yamanaka, K., Okimoto, N., Neya, S., Hata, M., Hoshino, T.: Behavior of Water Molecules in ATPase Pocket of Myosin. J. Mol. Struct. (THEOCHEM), 758, 97-105 (2006)
  4. Mie, Y., Kishida, M., Neya, S., Funasaki, N., Mizutani, F., Nishiyama, K., Taniguchi, I.: Electrochemical Analysis of Heme Functions of Myoglobin Using Semi-Artificial Myoglobins. J. Electroanal. Chem., 588, 226-234 (2006)
  5. Neya, S., Imai, K., Hiramatsu, Y., Kitagawa, T., Hoshino, T., Hata, M., Funasaki, N.: Significance of the Molecular Shape of Iron Corrphycene in a Protein Pocket. Inorg. Chem., 45, 4238-4242 (2006)
  6. Ode, H., Neya, S., Hata, M., Sugiura, W., Hoshino, T.: Computational Simulations of HIV-1 Proteases-Multi-drug Resistance Due to Nonactive Site Mutation L90M. J. Am. Chem. Soc., 128, 7887-7895 (2006)
  7. Miyauchi, K., Curran, R., Matthews, E., Komano, J., Hoshino, T., Engelman, D. M., Matsuda, Z.: Mutations of Conserved Glycine Residues within the Membrane-Spanning Domain of Human Immunodeficiency Virus Type 1 gp41 Can Inhibit Membrane Fusion and Incorporation of Env onto Virions. Jpn. J. Infect. Dis., 59, 77-84 (2006)
  8. Nishiyama, K., Watanabe, T., Hoshino, T., Ohdomari, I.: Analysis of Interactions between Luciferase and Si Substrates Using Molecular Dynamics Simulations. Jpn. J. Appl. Phys., 45, 1021-1025 (2006)
  9. Nakajima, J., Sato, Y., Hoshino, T., Yamazaki, M., Saito, K.: Mechanistic Study on the Oxidation of Anthocyanidin Synthase by Quantum Mechanical Calculation. J. Biol. Chem., 281, 21387-21398 (2006)
  10. Funasaki, N., Uratsuji, I., Okuno, T., Hirota, S., Neya, S.: Masking Mechnism of Bitter Taste of Drugs. Studied with Ion Selective Electrodes. Chem. Pharm. Bull., 54, 1156-1161 (2006)
  11. Koyama, M., Neya, S., Mizutani Y.: Role of Heme Propionates of Myoglobin in Vibrational Energy Relaxation. Chem. Phys. Lett., 430, 404-408 (2006)
  12. Hata, M., Marshall, G. R.: Do Benzodiazepines Mimic Reverse-turn Structures? J. Comput.-Aided Mol. Des. 20, 321-331 (2006)
  13. Neya, S., Quan, J., Hata, M., Hoshino, T., Funasaki, N.: A Novel and Efficient Synthesis of Porphine. Tetrahedron Lett., 47, 8731-8732 (2006)
  14. Ohgo, S., Neya, S., Uekusa, H., Nakamura, M.: An Isocyanide Probe for Heme Electronic Structure: Bis(tert-butylisocyanide) Complex od Diazaporphyrin Showing a Unique (dxy)2(dxz,dyz)3 Ground State. Chem. Commun. 4590-4592 (2006)
  15. Sato, Y., Hata, M., Neya, S., Hoshino, T.: Computational Analysis of the Proton Translocation from Asp96 to Schiff base in Bacteriorhodopsin. J. Phys. Chem. 110, 22804-22812 (2006)
  16. Gulam, R. M., Neya, S., Teraoka, J.: Resonance Raman Spectra of Highly Reduced Iron Porphycenes. J. Porphyrins Phthalocyanines 10, 1271-1284 (2006)
  17. Yuki, H., Tanaka, Y., Hata, M., Ishikawa, H., Neya, S., Hoshino, T.: Implementation of pi-pi Interactions in Molecular Dynamics Simulation. J. Comput. Chem. 28, 1091-1099 (2007)
  18. Ode, H., Matsuyama, S., Hata, M., Hoshino, T., Kakizawa, J., Sugiura, W.: Mechanism of Drug Resistance Due to N88S in CRF01_AE HIV-1 Protease, Analyzed by Molecular Dynamics Simulations. J. Med. Chem. 50, 1768-1777 (2007)
  19. Torimoto, N., Ishii, I., Hata, M., Kobayashi, Y., Nakamura, H., Ariyoshi, N., Kitada, M.: Theoretical Calculation of Triazolam Hydroxylation and Endogenous Steroid Inhibition in the Active Site of CYP3A4. Biochim. Biophys. Acta, Proteins Proteomics 1774, 223-232 (2007)
  20. Torimoto, N., Ishii, I., Toyama, K., Hata, M., Tanaka, K., Shimomura, H., Nakamura, H., Ariyoshi, N., Ohmori, S., Kitada, M.: Helices F-G Are Important for the Substrate Specificities of CYP3A7. Drug Metab. Dispos. 35, 484-492 (2007)
  21. Ode, H., Matsuyama, S., Hata, M., Neya, S., Kakizawa, J., Sugiura, W., Hoshino, T.: Computational Characterization of Structural Role of the Non-active Site Mutation M36I of Human Immunodeficiency Virus Type 1 Protease. J. Mol. Biol. 370, 598-607 (2007)
  22. Neya, S., Takahashi, A., Ode, H., Hoshino, T., Hata, M., Ikezaki A., Ohgo, Y., Takahashi, M., Hiramatsu, H., Kitagawa, T., Furutani, Y., Kandori H., Funasaki, N., Nakamura, M.: Magnetic and Infrared Properties of the Azide Complex of 2,7,12,17-[Tetra propylporphycenato]iron(III): A Novel Admixing Mechanism of the S = 5/2 and S = 3/2 States. Eur. J. Inorg. Chem. 2007, 3188-3194 (2007)
  23. Kanari, Y., Shoji, Y., Ode, H., Miyake, T., Tanii, T., Hoshino, T., Ohdomari, I. : Protein Adsorption on Self-Assembled Monolayers Induced by Surface Water Molecule. Jpn. J. Appl. Phys. 46, 6303-6308 (2007)
  24. Takaoka, T., Mori, K., Okimoto, N., Neya, S., Hoshino, T : Prediction of the structure of complexes comprised of proteins and glycosaminoglycans using docking simulation and cluster analysis. J. Chem. Theor. Comput. 3, 2347-2356 (2007)
  25. Nishiyama, K., Watanabe, T., Hoshino, T., Ohdomari, I. : nalysis of binding energies between luciferin and luciferase adsorbed on Si surface by docking simulations. Chem. Phys. Lett. 439, 148-150 (2007)

総説等

  1. Hata, M., Fujii, Y., Tanaka, Y., Ishikawa, H., Ishii, M., Neya, S., Tsuda, M., Hoshino, T.: Substrate Deacylation Mechanisms of Serine-β-lactamases. Biol. Pharm. Bull. 29, 2151-2159 (2006)
  2. 星野忠次, 大出裕高 : HIVプロテアーゼ阻害剤とウイルスの薬剤耐性、分子構造から考える薬物の作用機序(11). 医薬ジャーナル 43, No.12, pp.5-11 (2007)

学会発表

  1. 藤　秀義：リガンド結合様式予測プログラムの開発と抗HIV-1薬開発への応用．文部科学省「魅力ある大学院教育」イニシアティブ「情報集積型医療創薬を担う若手研究者の育成」 第一回講演発表会（2006）
  2. 藤　秀義，片桐大輔，星野忠次：標的タンパク質とリガンドの結合様式予測プログラムの開発．平成17年度総合メディア基盤センターIMIT研究会（2006）
  3. 藤　秀義，幸　瞳，服部知秀，根矢三郎，星野忠次：リガンド結合様式予測プログラムの開発．フィジカルファーマフォーラム2006（PPF2006）講演要旨集，14-17（2006）
  4. 森　健一，星野忠次：生体膜ー膜タンパク質複合体モデルの自動作成プログラムの開発．フィジカルファーマフォーラム2006（PPF2006）講演要旨集,18-19（2006）
  5. 高岡　翼，沖本憲明，森　健一，根矢三郎，星野忠次：AutoDockとクラスター分析を使用したグリコサミノグリカンとタンパク質複合体モデルの作成．フィジカルファーマフォーラム2006（PPF2006）講演要旨集,20-21（2006）
  6. 藤　秀義，幸　瞳，服部知秀，根矢三郎，星野忠次：リガンド結合 様式予測プログラムの開発．日本薬学会第126年会要旨集-2，11（2006）
  7. 根矢三郎，星野忠次，畑　晶之：コルフィセン異性体によるミオグロビン酸素親和性制御．日本薬学会第126年会要旨集-2，１５（2006）
  8. 高橋昭博，畑　晶之，星野忠次，平松弘嗣，北川禎三，根矢三郎：ヘム鉄の量子力学的スピン混合系における振動分光学的評価．日本薬学会第126年会要旨集-2，23（2006）
  9. 大出裕高，松山　翔，畑　晶之，根矢三郎，杉浦　亙，星野忠次：HIV-1プロテアーゼNon-active Site変異による薬剤耐性の分子動力学的機構解析．日本薬学会第126年会要旨集-2，37（2006）
  10. 高岡　翼，沖本憲明，森　健一，根矢三郎，星野忠次：Autodockとクラスター分析を使用したグリコサミノグリカンとタンパク質複合体モデルの作成．日本薬学会第126年会要旨集-2，37（2006）
  11. 成田友之，横幕能行，宮内浩典，松田善衛，松田昌和，杉浦　亙，根矢三郎，星野忠次：HIV-1薬剤耐性評価におけるHIV-1プロテアーゼ活性測定システムの構築．日本薬学会第126年会要旨集-3，103（2006）
  12. Neya, S., Hoshino, T., Hata, M.: Control of Oxygen Binding to Heme Iron by Porphyrin Variants. The 14th Takeda Science Foundation Symposium of Bioscience; The 50th Anniversary of Oxygenases. Advances and Reflections, Kyoto, Japan, Program & Abstracts, 93 (2006)
  13. Neya, S., Hoshino, T., Hata, M.: Biological Significance of Molecular Shape of Iron Corrphycene in Protein Cavity. The 16th Symposium on Role of Metals in Biological Reactions, Biology and Medicine (SMS 2006), Tokyo, Japan, Yakugaku Zasshi 126(suppl. 1), O-11 (2006)
  14. Neya, S., Hoshino T., Hata, M.: Functional Regulation of Myoglobin with Chemically Modified Corrphycenes. 4th International Conference on Porphyrins and Phthalocyanines, Rome, Italy, J. Porphyrins Phthalocyanines, 10, 796 (2006)
  15. Ode, H., Matsuyama, S., Neya, S., Hata, M., Sugiura, W., Hoshino, T. : NFV-Resistant Mechanism due to Non-active Site Mutation N88S on Subtype AE HIV-1 PRs. 2006 Annual Meeting of CBI Society, Tokyo, Japan, Proceedings, 54 (2006)
  16. Iwamoto, K., Neya, S., Hoshino, T. : Evaluation of the Binding Affinity of Antibodies from Antigen Binding Energy and VH-VL Interaction Energy Calculated by the MM-GBSA Method. 2006 Annual Meeting of CBI Society, Tokyo, Japan, Proceedings, 55 (2006)
  17. Takaoka, T., Okimoto, N., Mori, K., Neya, S., Hoshino, T. : Prediction of Complex Structure Comprised of a Protein and a Glycosaminoglycan Using Docking Simulation and Cluster Analysis. 2006 Annual Meeting of CBI Society, Tokyo, Japan, Proceedings, 56 (2006)
  18. Koyama, M., Neya, S., Mizutani, Y. : Effect of Heme Propionates on Dynamics of Myoglobin. 20th International Conference on Raman Spectroscopy (ICORS2006), Yokohama, Japan, Abstracts, 177 (2006)
  19. 根矢三郎，星野忠次，畑　晶之：ミオグロビンの酸素運搬分子への変換：新しい酸素運搬物質の創製．第13回日本血液代替物学会年次大会，人工血液，14，16（2006）
  20. 根矢三郎，高橋昭博，畑　晶之，星野忠次，池崎　章，大胡惠樹，中村幹夫：酸化型ヘム鉄での中間スピン高スピン混合系はスピン平衡系である．第56回錯体化学討論会講演要旨集，132（2006）
  21. 森脇　崇，ラッバニ・グラム，松下淑夫，根矢三郎，寺岡淳二：ポルフィリン誘導体のピロールＮプロトン化物の共鳴ラマンスペクトル．第56回錯体化学討論会講演要旨集，351（2006）
  22. Ando, S., Hata, M., Tozuka, Y., Moribe, K., Yamamoto, K.: Equimolar Complex Formation of Ethenzamide or 2-Methoxybenzamide with Ureal Compounds: Investigation of Complexation Mechanism by Theoretical Calculation. Asian Pharmaceutics Graduate Congress: The Science of Product Design and Pharmaceutical Technology, Singapore, Singapore (2006)
  23. 大胡惠樹，根矢三郎，高橋　正，竹田満州雄，中村幹夫：ポルフィリン関連化合物鉄(III)ヨウ素錯体の新規スピンクロスオーバー挙動に関する研究．第9回ヨウ素利用研究国際シンポジウム発表要旨集，５（2006）
  24. 星野忠次，森　健一：糖鎖生体膜シミュレーションモデルによる膜タンパク質の挙動解析．第26回表面科学講演大会講演要旨集，33（2006）
  25. Fuji, H., Tatsumi, J., Komano, J., Hoshino, T.: Development of HIV-1 RNaseH inhibitor by Computer-Assisted Drug Design. Fifth East Asian Biophysics Symposium & Forty-Fourth Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, Okinawa, Japan, Program, 442 (2006)
  26. 駒野　淳，姉崎裕介，二橋悠子，磯貝まや，藤　秀義，星野忠次，武部　豊，山本直樹：HIV-1の逆転写酵素が持つRNase H活性に対する特異的阻害剤の開発．第54回日本ウイルス学会学術集会 (2006)
  27. 藤　秀義，辰巳絢子，駒野　淳，星野忠次：HIV-1の逆転写酵素に内在するRNase H活性阻害薬の開発 −in silico解析による作用機序解析と最適化の試み−．第20回日本エイズ学会学術集会・総会抄録集，214（2006）
  28. 大出裕高，松山 翔，柿澤淳子，杉浦　亙，星野忠次：CRF01_AE HIV-1におけるNFV耐性変異N88Sの出現メカニズムに関する構造学的知見．第20回日本エイズ学会学術集会・総会抄録集，241（2006）
  29. Ohgo, Y., Neya, S., Uekusa, H., Nakamura, M..: Bis(tert-butylisocyanide) Complex of Diazaporphyrin Showing a Unique (dxy)2(dxz, dyz)3 Ground State. 233rd ACS National Meeting, Chicago, United States (2007)
  30. 藤　秀義，星野忠次：疎水性相互作用による結合様式の予測．日本薬学会第127年会要旨集３，９（2007）
  31. 野地史隆，星野忠次，畑　晶之，根矢三郎：カルボキシル基が移動したポルフィリンの合成と性質．日本薬学会第127年会要旨集３，25（2007）
  32. 上田厚子，根矢三郎，星野忠次，畑　晶之：コルフィセンの合成と人工血液素材としての利用．日本薬学会第127年会要旨集３，25（2007）
  33. 根矢三郎，星野忠次，畑　晶之：鉄ピリポルフィリンで再構成した新規ミオグロビンの反応性．日本薬学会第127年会要旨集３，26（2007）
  34. 大出裕高，松山　翔，畑　晶之，根矢三郎，杉浦　亙，星野忠次：HIV-1プロテアーゼNon-active Site変異M36Iの分子動力学的機能解析．日本薬学会第127年会要旨集３，53（2007）
  35. 久富喜弘，片桐大輔，根矢三郎，原　正彦，星野忠次：蛍光タンパク質のアンフォールディングの分子動力学シミュレーション．日本薬学会第127年会要旨集３，54（2007）
  36. 高村　斉，大出裕高，新本裕子，根矢三郎，星野忠次：新規抗HIV薬の合成研究．日本薬学会第127年会要旨集３，54（2007）
  37. 今井陽介，森　健一，根矢三郎，星野忠次：分子動力学計算によるセラミドの物性評価．日本薬学会第127年会要旨集３，54（2007）
  38. 辰巳絢子，藤　秀義，高村　斉，駒野　淳，根矢三郎，星野忠次：HIV-1のRNaseH活性を阻害する薬物の設計と評価．日本薬学会第127年会要旨集３，54（2007）
  39. 岩本光司，根矢三郎，星野忠次：分子動力学計算による抗体親和性評価．日本薬学会第127年会要旨集３，55（2007）
  40. 高岡　翼，根矢三郎，星野忠次：分子動力学計算を用いたヘパリンによるウロキナーゼ活性化機構の解明．日本薬学会第127年会要旨集３，55（2007）
  41. 畑　晶之，Garland Marshall：ベンゾジアゼピン系化合物はβ-ターン構造を模倣しているか？．日本薬学会第127年会要旨集３，56（2007）
  42. Hoshino, T., Mori, K. : Investigation on the binding of amyloid peptides to a GM1 cluster through the moleculardynamics simulations of GM1-containing membranes. 1st International Symposium on Nanomedicine -from Basic to Applications- (ISNM2007) & 2nd Molecule-Based Information Transmission and Reception (MB-ITR2007), Okazaki, Japan, Proceedings, 33 (2007)
  43. Nakamura, M., Ohgo, Y,. Ikazaki, A., Eguchi, E., Neya, S. : Unsusual electronic and magnetic properties in iron(III) porphyrinoids 1st Georgian Bay International Conference on Bioinorganic Chemistry. Parry Sound, Canada, (2007)
  44. Nakamura, M., Ohgo, Y,. Ikazaki, A., Eguchi, E., Neya, S. : Formation of iron(III) porphyrinates with unusual electronic and magnetic properties 13th International conference of biological inorganic chemistry, Vienna, Austria, (2007)
  45. Ohgo, Y., Neya, S., Nakamura, M.: Change in Nonplanarity of heme as electron transfer switch 13th International conference of biological inorganic chemistry, Vienna, Austria, (2007)
  46. 沖本憲明，二木紀行，末永　敦，藤　秀義，野内涼子，大野洋介，成見　哲，泰地真弘人：分子ドッキングと分子動力学計算を組み合わせた計算機支援による医薬品開発．日本薬学会第127年会（2007）
  47. 二木紀行，沖本憲明，末永　敦，藤　秀義，野内涼子，大野洋介，成見　哲，泰地真弘人：分子ドッキングと分子動力学計算を組み合わせた計算機支援による医薬品開発．第15回システムバイオロジー研究会（2007）
  48. 藤　秀義，辰巳絢子，栗田明宙，駒野　淳，星野忠次：コンピュータ支援によるHIV-1治療薬の開発．レトロウイルス研究会夏期セミナー2007プログラム（2007）特別賞受賞
  49. Neya, S., Hoshino, T. : Pursuit of the biological function of a novel porphyrinoid replaced with a pyridine ring. The 17th symposium on the role of metals in biological reactions, biology, and medicine (SRM2007). Yakugaku Zasshi, 127, 17, (2007)
  50. 根矢三郎、星野忠次：ミオグロビンの新たな酸素親和性制御因子．日本血液代替物学会第１４回年次大会、人工血液15, 14（2007）
  51. Hoshino, T. : Computational design, organic chemical synthesis, and biological assay of an inhibitor against HIV-1 protease. The 2nd Workshop on Biological Applications of Plasma/Photon Processing, (2007)
  52. Ode, H., Matsuo, Y., Neya, S., Hoshino, T. : Development of AMBER Force Field for Nucleic Acids. 2007 Annual Meeting of CBI Society, Hiroshima, Japan, Proceedings, 66 (2007)
  53. Matsuo, Y., Ode, H., Hirohashi, Y., Torigoe, T., Sato, N., Neya, S., Hoshino, T. : Computational and Biochemical Investigation on the Binding Affinities of Peptides with HLAs. 2007 Annual Meeting of CBI Society, Hiroshima, Japan, Proceedings, 73 (2007)
  54. Okimoto, N., Futatsugi, N., Suenaga, A., Fuji, H., Yanai, R., Ohno, Y., Narumi, T., Taiji, M. : Virtual screening by combining molecular docking and molecular dynamics simulation. 2007 Annual Meeting of CBI Society, Hiroshima, Japan, Proceedings, 88 (2007)
  55. Hisatomi, H., Katagiri, D., Neya, S., Hoshino, T. : Novel ab initio Secondary Structure Prediction Method. 2007 Annual Meeting of CBI Society, Hiroshima, Japan, Proceedings, 115 (2007)
  56. Futatsugi, N., Okimoto, N., Suenaga, A., Fuji, H., Narumi, T., Ohno, Y., Yanai, R., Taiji, M. : In Silico Prediction of Side Effects on Drug Development. 2007 Annual Meeting of CBI Society, Hiroshima, Japan, Proceedings, 136 (2007)
  57. 松尾佑里, 大出裕高, 廣橋良彦, 鳥越俊彦, 佐藤昇志, 根矢三郎, 星野忠次：計算化学と生化学実験を用いたHLA適合ペプチドの新規親和性評価系の構築．第51回日本薬学会 関東支部大会 講演要旨集, p55 (2007) 東京
  58. 星野忠次：計算機による特異的抗体設計法の確立．科学技術振興機構・シミュレーション技術の革新と実用化基盤の構築 第３回 シンポジウム, (2007) 東京
  59. 中里俊文, 高村斉, 大出裕高, 清水愛, 杉浦 亙, 星野忠次：L90M変異体に阻害作用をもつ抗HIV薬の設計・合成．第21回日本エイズ学会学術集会・総会抄録集, 167 (2007) 広島
  60. 松山翔, 大出裕高, 柿澤淳子, 杉浦亙, 星野忠次：臨床検体由来SubtypeC HIV-1 proteaseの薬剤耐性機構に関する構造化学的研究．第21回日本エイズ学会学術集会・総会抄録集, 268 (2007) 広島
  61. 柿澤淳子, 松山翔, 大出裕高, 星野忠次, 大高泰靖, 岩谷靖雅, 西澤雅子, Rajintha Bandaranayake, Celia A. Schiffer, 杉浦亙：CRF01_AEとサブタイプBのプロテアーゼの構造解析．第21回日本エイズ学会学術集会・総会抄録集, 268 (2007) 広島
  62. 大出裕高, 横幕能行, 松山翔, 伊部史朗, 藤崎誠一郎, 間宮均人, 濱口元洋, 金田次弘, 星野忠次：コンピュータ・シミュレーションで薬剤耐性HIV-1に対する薬効の予測は可能か?第21回日本エイズ学会学術集会・総会抄録集, 311 (2007) 広島
  63. 松尾佑里, 大出裕高, 廣橋良彦, 鳥越俊彦, 佐藤昇志, 根矢三郎, 星野忠次：HLAとエピトープ間の結合親和性に関する理論的及び生物化学的研究．第45回日本生物物理学会 講演予稿集, 135 (2007) 横浜
  64. 藤秀義，浦野恵美子，厳　馬華，中原徹，堤浩，濱武牧子，宮内浩典，森川裕子，玉村啓和，杉浦亙，山本直樹，駒野淳，星野忠次：ドッキングシミュレーションによるHIV-1インテグラーゼ阻害活性を有するペプチドの分子設計．第45回日本生物物理学会 講演予稿集, S126 (2007) 横浜
  65. Neya, S., Hoshino, T.:Iron corrphycene containing myoglobin. Joint Congress of The International Federation for Artificial Organs and The International Faculty of Artificial Organs.Abstruct No. SY-508, Artificial Organs 31, A40, (2007) Osaka
  66. 大胡惠樹、根矢三郎、橋爪大輔、中村幹夫：ポルフィリン類縁体鉄（III）イソシアニド錯体の物性と構造．日本化学会第８８春季年会、講演番号, 5E6-32 (2007) 東京
  67. 中村賢一郎、池崎章、大胡惠樹、根矢三郎、中村幹夫：6配位モノアザポルフィリン鉄（III）錯体の電子構造．日本化学会第８８春季年会、講演番号, 4PA-144 (2007) 東京
  68. 古谷祐詞、神取秀樹、池崎章、大胡惠樹、中村幹夫、根矢三郎：２、７、１２、１７−テトラプロピルポルフィセン鉄（III）錯体に結合したアジドの温度依存的な赤外吸収変化の解析によるスピン状態の考察．第５７回錯体化学討論会講演要旨集, p. 193、発表番号, 1PB-008 (2007) 名古屋
  69. 木瀬史祐、宮崎知子、根矢三郎、寺岡淳二：ポルフィリン類縁化合物の分子構造と電子状態．第５７回錯体化学討論会講演要旨集, p. 204、発表番号, 1PB-030 (2007) 名古屋
  70. 根矢三郎、星野忠次：エステル置換基除去による効率的ポルフィン合成法．第５７回錯体化学討論会講演要旨集, p. 226、発表番号, 1PE-003 (2007) 名古屋
  71. 大胡惠樹、星野哲人、根矢三郎、岡村知弥、植草秀裕、橋詰大輔、中村幹夫：ポルフィリン類の非平面化と電子配置のスイッチング．第５７回錯体化学討論会講演要旨集, p. 84、発表番号, 2Ba-002 (2007) 名古屋
  72. 根矢三郎、星野忠次：ピリジン環で置換した鉄ポルフィリンをもつミオグロビン．第５７回錯体化学討論会講演要旨集, p. 107、発表番号, 2Ea-007 (2007) 名古屋
  73. 森脇崇、根矢三郎、寺岡淳二：鉄ポルフィセン錯体の電子吸収スペクトルの温度変化．第５７回錯体化学討論会講演要旨集, p. 314、発表番号, 2PB-005 (2007) 名古屋
  74. 江口創、大胡惠樹、池崎章、根矢三郎、中村幹夫：６配位オキシピリポルフィリン鉄（III）錯体の電子状態．第５７回錯体化学討論会講演要旨集, p. 316、発表番号, 2PB-009 (2007) 名古屋
  75. Neya, S., Hoshino, T.:Infrared and Magnetic Properties of Nonplanaer Iron(III) Porphyrin Azide:Proposal of a Novel Mechanism of Spin AdmixingInternational Symposium on Metallomics 2007, Chemical Society of Japan, Nagoya, Japan. Abstract p. 140, (November 28-December 1, 2007)

単行書

  1. 根矢三郎（分担執筆）：スタンダード教科書シリーズ３「物理化学」石田寿昌編（化学同人）1-64ページ（２００７）

特　許

  1. 根矢三郎：人工血液．特願2006-118249 (2006)
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